三泽塾，全名为是一间全国规模且市场占有率最高的升学补习班。而位于学院都市的三泽塾学园都市分校，其实是为了盗取学园都市特有的“超能力学习法”而设立的，换句话来讲就是一个企业间谍。

但是这所在学园都市的分校，却因为某种奇妙的变化，把学园都市的能力开发给延伸解释为了一种“神迹”，变成了以科学崇拜为主轴的新兴宗教。

不仅拒绝三泽塾总部的命令，而且还监禁了一个拥有着特殊能力的少女