按照青檀书院的学习规程，早间和下午均有一个半时辰的教学时间，有负责教授经义的教授、助教来分堂进行授课，而晚间则主要是进行策论的学习探讨。

而每月的四、十四、二十四则是例行的品德修养的自我检视和砥砺，每一位学子都要写一篇对作为文人士子在自我修养上的感悟，这也是青檀书院与其他书院的一大差别。

随着太上皇当政后期，从会试以原来的经义为主策论为辅逐渐开始演变。

元熙二