吕祖谦与朱熹一并师从于胡宪，两人是非常好的朋友，同时吕祖谦也与陆九渊交好。

儒学上著名的'鹅湖之会'，就是吕祖谦一手促成的，

吕祖谦对于朱熹的学问十分佩服，曾有称赞朱熹的学问就实入细，殊为可量，大意就是说朱熹的学问深不可测，犹如扫地僧般的存在。

不过朱熹对于吕祖谦看法却有保留。

学生请教朱熹说'东莱之学'如何，他说这位老朋友'于史分外仔细，于经却不甚